دوره 18، شماره 47 - ( شماره 1 و 2-زیست شناسی از صفحه 667 تا 696 و زمین شناسی از صفحه 697 تا 737 1386 )
جلد 18 شماره 47 صفحات 180-171 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Computational comparison of antigenic sites of C2-V3-C3 regions of gp-120 of the Iranian HIV-1 with the homologous regions of different subtypes of the virus. Journal title 2007; 18 (47) :171-180
URL: http://jsci.khu.ac.ir/article-1-1192-fa.html
URL: http://jsci.khu.ac.ir/article-1-1192-fa.html
مقایسه کامپیوتری اپیتوپ‌های نواحی C2-V3-C3 گلیکوپروتئین ۱۲۰gp ایزوله ایرانی H IV-1با نواحی همولوگ در زیرگونه‌های گوناگون این ویروس. عنوان نشریه. 1386; 18 (47) :171-180
چکیده: (4950 مشاهده)
در تحقیق حاضر اپیتوپ‌های پیش‌بینی شده در نواحی C2-V3-C3در۱۲۰ gp ایزوله ایرانی ویروس 1 HIV-بااپیتوپ‌های نواحی مشابه در زیرگونه‌های A تا I این ویروس مقایسه شده‌اند. از آن‌جا که نواحی اپیتوپ یک پروتئین مناطقی فاقد ساختمان ثانویه و آب دوست هستند که در تماس با محلول آبی‌اند از این فاکتورها برای پیش‌بینی اپیتوپ‌ها استفاده شد. تعداد نواحی هلیکس(١) و شیت‌ها(٥) درایزوله ایرانی با تعداد آن‌ها در زیرگونه F و Aبرابر بود. روش هوبارد٧ محل بالقوه گلیکوزیلاسیون را در ایزوله ایرانی تعیین کرد. در تمام زیرگونه‌های دیگر تعداد محل‌های بالقوه گلیکوزیلاسیون کم‌تر از ٧ بود. در تمام ایزوله‌ها از جمله ایزوله ایرانی، یک اپیتوپ در یک ناحیه مشابه پیش‌بینی شد. در تمام نواحی بررسی شده (به جز ایزوله ایرانی و زیرگونه‌های D و H) یک اپیتوپ طویل واحد در ناحیه‌ای دیگر پیش بینی شد. در زیرگونه H هیچ اپیتوپی در این ناحیه پیش‌بینی نشد. در ایزوله ایرانی و درزیرگونه Dدو اپیتوپ کوتاه در این ناحیه پیش‌بینی شد. آنالیز کامپیوتری، شباهت‌ها و تفاوت‌های بین موقعیت اپیتوپ‌های زیرگونه ایرانی و سایر ویروس‌های HIV-1 پیش‌بینی کرد. اگر چه ساختار اولیه ۱۲۰ gpزیرگونه ایرانی به زیرگونه B نزدیک است، برخی تفاوت‌ها بین ساختار دوم وسوم این ویروس و ساب تیپ B پیش بینی می‌شوند.
انتشار: 1386/1/26
| بازنشر اطلاعات | |
 | این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
